Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod1Q8BVA4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms