Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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