Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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H2-M10.4Q85ZW8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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H2-M10.4Q85ZW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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H2-M10.4Q85ZW8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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