Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

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Length 1,130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmc3Q7TQ69 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms