Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SynmQ70IV5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms