Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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