Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfrkbQ6PIJ4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfrkbQ6PIJ4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms