Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms