Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nckap5lQ6GQX2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms