Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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