Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE9

Tshz2, Teashirt homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz2Q68FE9 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tshz2Q68FE9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tshz2Q68FE9 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms