Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms