Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms