Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms