Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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