Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms