Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms