Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SkiQ60698 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms