Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms