Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggnbp2Q5SV77 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms