Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms