Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms