Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 726.1 ms