Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbof1Q3V079 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms