Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms