Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Cops9Q3U898 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Cops9Q3U898 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Cops9Q3U898 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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