Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U6N9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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