Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hvcn1Q3U2S8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hvcn1Q3U2S8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms