Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms