Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms