Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms