Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prex2Q3LAC4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prex2Q3LAC4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms