Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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