Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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