Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms