Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms