Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms