Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms