Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms