Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grin2cQ01098 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms