Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pde1bQ01065 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde1bQ01065 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms