Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
rp9P97762 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
rp9P97762 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
rp9P97762 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
rp9P97762 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms