Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Arf1P84078 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Arf1P84078 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Arf1P84078 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms