Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms