Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CiitaP79621 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms