Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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