Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sem1P60897 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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