Protein–RNA interactions for Protein: P58462

Foxp1, Forkhead box protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp1P58462 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp1P58462 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp1P58462 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp1P58462 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp1P58462 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp1P58462 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp1P58462 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms