Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2e3P52483 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms