Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp10P52479 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp10P52479 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp10P52479 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp10P52479 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms